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Bacillus subtilis

Pre-sporulation stage -
the vegetative state of B. subtilis cells

 

t1 50 Cytoscape vegetativestate 50 xlsx-3
Gene expression values of represented genes during the stage of vegetative growth.

All genes part of the active regulons during vegetative growth were clustered based on the regulation of their expression (see list on the right). Their cognate gene expression values are represented in a heatmap showing upregulation as positive values and downregulation as negative values. Sporulation- and germination-specific expression data was retrieved from supplementary data Table S2 of Nicolas et al. 2012 183 . Subsequently, the replicates were averaged and normalized to t=0 (initiation of sporulation) of the sporulation data column.
Microsoft Excel was used to visualize the expression values using automated two colour conditional formatting (red for downregulated and blue for upregulated). In the heatmap, t=0 to t=8 indicate the number of hours after initiation of sporulation as described in supplementary data Table S1 by Nicolas et al. 2012 183 . The final three columns contain expression data at 135 minutes, 150 minutes and 180 minutes after addition of spore germination trigger alanine to purified spores of B. subtilis 183 .

 

                          ger ger ger
Class Gene Locus tag   t=0 t=1 t=2 t=3 t=4 t=5 t=6 t=7 t=8 135 150 180
A albA BSU37370   0,0 -2,6 1,6 -2,5 -2,9 -2,8 -1,8 -2,1 -2,6 -3,2 -2,9 -3,5
A albB BSU37380   0,0 -2,5 1,6 -2,5 -3,0 -2,8 -1,9 -1,8 -2,3 -2,6 -2,5 -2,6
A albC BSU37390   0,0 -2,0 1,7 -2,5 -3,1 -2,9 -2,3 -3,2 -3,2 -2,0 -1,8 -2,1
A albD BSU37400   0,0 -1,6 2,2 -2,2 -3,0 -2,8 -2,2 -3,1 -3,3 -1,4 -1,3 -1,6
A albE BSU37410   0,0 -1,3 2,6 -1,9 -2,9 -3,0 -3,3 -3,6 -3,7 -1,8 -1,5 -1,7
A albF BSU37420   0,0 -0,8 3,1 -1,4 -2,2 -2,4 -2,6 -2,8 -2,8 -2,2 -1,5 -1,9
A albG BSU37430   0,0 -0,7 3,1 -1,2 -2,0 -2,2 -2,1 -2,3 -2,2 -2,3 -1,6 -2,0
A antE BSU25220   0,0 -0,3 0,6 0,2 -0,1 -0,4 0,5 1,0 2,2 0,3 -0,6 -0,8
A asnH BSU39920   0,0 6,0 5,7 5,3 4,9 3,8 1,9 2,5 1,0 0,2 0,5 0,5
A bdbA BSU21460   0,0 1,2 0,7 -2,4 -3,3 -4,6 -5,5 -3,9 -3,1 -4,7 -4,3 -5,3
A bdbB BSU21440   0,0 0,5 0,0 -2,8 -3,7 -4,6 -5,6 -4,5 -4,1 -4,0 -4,3 -4,3
A bdhA BSU06240   0,0 -1,4 -2,1 -3,2 -3,9 -4,4 -4,3 -4,4 -4,4 -4,0 -3,2 -4,5
A besA BSU32010   0,0 1,4 2,7 -0,9 1,7 1,2 0,0 0,1 -1,2 0,0 1,4 -0,4
A cccA BSU25190   0,0 -0,1 1,1 0,5 0,8 0,5 -0,1 0,6 0,1 -3,5 -2,7 -3,4
A comK BSU10420   0,0 1,0 1,3 0,4 0,6 0,2 0,1 0,0 -0,3 -3,4 -3,2 -3,3
A csn BSU26890   0,0 -2,2 0,4 -1,1 -1,8 -2,1 -2,5 -2,2 -2,9 -4,9 -4,2 -4,5
A ctaB BSU14880   0,0 -1,3 0,2 -0,6 -0,3 -0,7 -1,2 -1,0 -1,1 0,0 -0,5 -0,1
A ctaC BSU14890   0,0 -0,6 1,4 1,0 1,1 1,2 0,4 0,7 0,2 -3,3 -3,1 -3,4
A ctaD BSU14900   0,0 -1,2 1,0 0,6 0,6 0,7 0,3 0,3 0,0 -3,7 -3,3 -3,9
A ctaE BSU14910   0,0 -1,4 0,7 0,4 0,3 0,5 0,4 0,4 0,2 -3,7 -3,4 -4,0
A ctaF BSU14920   0,0 -1,4 0,8 0,5 0,5 0,6 0,6 0,6 0,6 -3,7 -3,5 -3,9
A ctaG BSU14930   0,0 -1,2 0,9 0,3 0,3 0,6 0,4 0,4 0,3 -3,3 -3,1 -3,6
A ctaO BSU12080   0,0 -2,0 1,7 -0,1 -0,3 1,1 1,6 1,5 1,7 -1,9 -1,6 -2,0
A cwlS BSU19410   0,0 0,6 1,5 -0,1 -0,5 -1,6 -2,9 -3,1 -4,1 -4,1 -3,5 -3,7
A cypX BSU35060   0,0 -2,7 -1,9 -3,0 -3,7 -3,9 -3,9 -3,8 -3,7 -2,1 -2,0 -2,1
A dacF BSU23480   0,0 -0,5 0,6 7,1 7,3 6,7 6,3 6,6 6,4 0,0 -0,2 0,1
A dhbA BSU32000   0,0 2,4 4,2 -0,3 2,7 1,7 0,1 -0,8 -1,1 2,0 3,4 0,8
A dhbB BSU31970   0,0 2,5 4,6 0,2 3,5 1,7 0,2 -0,6 -1,0 2,2 3,4 0,9
A dhbC BSU31990   0,0 2,4 4,3 -0,1 2,9 1,5 0,0 -0,4 -0,8 2,1 3,4 0,8
A dhbE BSU31980   0,0 2,4 4,4 0,0 3,0 1,2 -0,2 -0,7 -0,9 2,1 3,5 0,8
A dhbF BSU31960   0,0 1,8 4,8 0,3 3,3 1,3 -0,1 -0,5 -0,6 1,9 3,0 0,6
A lip BSU02700   0,0 -0,8 0,6 -0,2 -0,9 -2,1 -4,8 -4,9 -5,2 -2,8 -2,1 -2,7
A mcpA BSU31240   0,0 -1,0 -1,8 -3,6 -3,9 -4,0 -3,2 -4,2 -4,2 -5,4 -4,6 -4,7
A ntdR BSU10560   0,0 2,2 2,3 2,5 2,2 1,8 0,7 0,7 -0,1 -1,4 -1,0 -1,3
A pbpH BSU13980   0,0 -0,7 -1,1 -1,4 -2,0 -2,1 -1,9 -2,7 -2,2 -1,9 -1,2 -1,9
A phrE BSU25840   0,0 0,8 1,5 1,1 1,2 0,5 0,4 0,8 0,8 -2,4 -2,2 -2,5
A phrH BSU06839   0,0 0,5 0,9 0,0 -0,6 -1,2 -1,8 -2,1 -3,1 -4,2 -3,7 -4,0
A phrK BSU18920   0,0 0,6 1,9 0,8 1,0 0,3 -1,1 0,2 -1,2 -4,4 -4,1 -4,2
A phy BSU19800   0,0 -0,1 0,8 0,7 1,2 1,1 1,0 1,1 1,7 -0,7 -0,6 -0,6
A pnbA BSU34390   0,0 0,4 1,1 1,1 0,7 0,5 0,1 -0,6 -1,3 -0,8 -0,3 -0,9
A ppsA BSU18340   0,0 2,5 2,2 0,8 0,3 -0,1 -0,9 -1,2 -1,5 -2,1 -1,9 -2,1
A ppsB BSU18330   0,0 2,6 2,1 0,6 -0,1 -0,6 -0,7 -1,4 -1,7 -1,7 -1,4 -1,5
A ppsC BSU18320   0,0 2,1 1,9 0,5 0,0 -0,6 -1,1 -1,8 -2,0 -1,6 -1,3 -1,4
A ppsD BSU18310   0,0 1,7 1,9 0,3 -0,2 -0,9 -1,3 -1,9 -2,0 -1,2 -0,8 -1,0
A ppsE BSU18300   0,0 1,2 1,8 0,2 -0,1 -0,7 -1,1 -1,7 -1,9 -1,0 -0,8 -0,8
A pspA BSU06180   0,0 -1,5 -3,0 -5,0 -5,1 -5,5 -4,7 -6,2 -5,2 -2,3 -2,0 -2,7
A ptkA BSU36250   0,0 0,1 0,4 -0,8 -1,7 -2,0 -3,3 -3,2 -3,1 -0,3 0,2 -0,2
A ptpZ BSU36240   0,0 -1,0 -1,0 -1,9 -2,2 -2,3 -2,5 -2,5 -2,5 0,3 0,8 0,4
A qcrA BSU22560   0,0 -0,8 0,6 0,3 0,0 0,2 -0,7 -0,5 -1,1 -4,3 -3,5 -4,5
A qcrB BSU22550   0,0 -1,1 0,5 0,0 -0,2 -0,1 -1,2 -0,5 -1,7 -4,2 -3,5 -4,7
A qcrC BSU22540   0,0 -0,9 0,8 0,2 0,2 0,2 -0,7 -0,2 -0,9 -4,5 -3,9 -4,7
A rapK BSU18910   0,0 1,9 1,6 0,5 -0,1 -1,1 -2,5 -0,8 -1,2 -3,1 -2,9 -3,2
A rocA BSU37780   0,0 -5,1 -6,8 -7,7 -7,9 -7,9 -7,7 -8,2 -8,1 -6,6 -6,1 -7,4
A rocB BSU37770   0,0 -3,9 -5,3 -5,8 -6,0 -6,0 -5,9 -6,3 -6,1 -6,1 -6,0 -6,3
A rocC BSU37760   0,0 -2,6 -3,2 -3,9 -4,0 -3,8 -2,6 -4,2 -4,2 -3,8 -3,8 -3,9
A rocG BSU37790   0,0 -4,5 -6,5 -7,2 -7,4 -7,5 -7,3 -7,5 -7,4 -7,2 -5,4 -7,2
A rsiW BSU01740   0,0 -0,9 -1,4 -2,2 -2,2 -2,3 -1,7 -2,5 -1,4 0,2 0,0 -0,5
A sboA BSU37350   0,0 -2,1 2,0 -0,2 -2,5 -4,5 -4,1 -4,1 -4,2 -5,9 -5,5 -5,6
A sboX BSU37360   0,0 -3,3 2,5 -2,5 -2,6 -4,6 -4,2 -3,9 -4,1 -5,0 -4,8 -5,0
A sdpA BSU33750   0,0 3,1 3,3 1,9 1,9 0,5 -1,9 -1,3 -1,7 -3,5 -3,9 -3,9
A sdpB BSU33760   0,0 3,4 3,3 1,8 1,5 0,1 -2,8 -1,4 -2,1 -3,8 -4,2 -4,1
A sdpC BSU33770   0,0 0,9 1,0 0,9 0,9 0,8 -0,7 -0,1 -2,0 -5,8 -5,8 -5,8
A sdpI BSU33780   0,0 -0,2 -0,1 0,3 -0,5 -0,7 0,3 1,9 1,9 -0,1 -0,5 -0,6
A sdpR BSU33790   0,0 0,0 0,2 0,3 -0,6 -0,8 0,1 1,9 2,1 -0,3 -0,5 -0,4
A sigW BSU01730   0,0 -1,0 -1,5 -2,4 -2,1 -2,5 -1,9 -2,8 -1,6 0,0 -0,2 -0,4
A skfA BSU01910   0,0 0,9 3,6 3,7 3,6 3,4 3,4 3,2 3,3 -2,9 -2,5 -2,3
A skfB BSU01920   0,0 1,2 4,5 3,8 3,5 2,2 0,9 1,3 0,3 -1,3 -1,1 -1,2
A skfC BSU01935   0,0 1,1 4,2 3,5 3,0 1,8 0,6 1,0 -0,1 -1,4 -1,1 -1,2
A skfE BSU01950   0,0 1,5 3,7 2,9 2,6 1,4 0,4 0,5 -0,6 -1,6 -1,4 -1,5
A skfF BSU01960   0,0 1,6 3,9 3,1 2,6 1,5 0,6 0,7 -0,4 -1,0 -0,9 -1,0
A skfG BSU01970   0,0 1,7 3,8 3,2 2,8 1,8 0,8 1,1 -0,1 -1,0 -1,0 -0,8
A skfH BSU01980   0,0 1,7 3,9 3,3 2,9 1,9 0,9 1,4 0,6 -0,7 -0,9 -0,7
A sunA BSU21480   0,0 0,4 0,3 -1,1 -1,8 -3,2 -3,5 -2,9 -3,0 -6,3 -5,6 -6,2
A sunS BSU21450   0,0 0,8 0,1 -2,7 -3,6 -4,8 -5,8 -4,2 -3,8 -4,4 -4,3 -4,4
A sunT BSU21470   0,0 1,6 0,8 -2,0 -2,4 -4,2 -5,5 -3,8 -2,8 -5,1 -4,1 -5,1
A tkmA BSU36260   0,0 0,5 0,5 -0,3 -0,8 -0,9 -2,1 -2,0 -2,1 0,1 0,7 0,4
A tlpA BSU31250   0,0 -1,0 -1,3 -2,7 -2,8 -2,9 -3,0 -3,5 -3,4 -3,7 -3,7 -3,6
A xynC BSU18150   0,0 -0,9 0,0 0,0 -0,2 -0,2 -0,5 -1,0 -1,8 -1,5 -1,3 -1,6
A xynD BSU18160   0,0 -0,6 0,3 0,3 0,2 0,1 -0,4 -0,8 -1,9 -2,3 -1,5 -2,1
A ybaJ BSU01510   0,0 1,2 0,5 -0,4 -0,5 -1,0 -2,9 -2,0 -2,2 -0,2 -0,1 0,1
A ybdN BSU02040   0,0 2,0 2,2 1,2 0,6 -0,1 -1,7 -1,6 -2,9 -3,0 -2,6 -3,0
A ybdO BSU02050   0,0 0,0 -0,2 -2,3 -2,3 -2,9 -3,4 -3,3 -3,5 -3,4 -3,6 -3,3
A ybfO BSU02310   0,0 -1,2 -0,8 -2,8 -2,7 -3,1 -2,1 -3,8 -2,2 -2,5 -2,2 -2,8
A ybfP BSU02320   0,0 -1,1 -1,2 -2,2 -2,4 -2,6 -1,9 -2,6 -2,4 -1,0 -0,7 -1,0
A ycbC BSU02460   0,0 0,5 0,4 -0,2 -0,3 -0,2 0,0 -0,2 0,1 -0,3 0,1 -0,1
A ycbD BSU02470   0,0 0,3 0,3 -0,2 -0,3 -0,3 0,0 -0,4 -0,4 -0,4 -0,1 -0,2
A ycbE BSU02480   0,0 0,4 0,2 -0,1 -0,2 -0,1 -0,1 -0,4 -0,5 -0,1 0,0 -0,1
A ycbF BSU02490   0,0 0,8 0,4 -0,1 -0,2 -0,2 -0,1 -0,5 -0,5 -0,7 -0,4 -0,6
A ycbG BSU02500   0,0 0,9 0,0 -0,7 -1,0 -1,3 -1,2 -2,2 -2,4 0,9 0,9 1,3
A ycbH BSU02510   0,0 0,5 -0,1 -0,7 -1,0 -1,0 -0,5 -1,5 -1,5 -0,3 0,4 -0,5
A ycbJ BSU02520   0,0 -0,6 -0,6 -0,1 0,1 0,3 0,6 0,7 0,1 -1,4 -1,1 -1,5
A ycdA BSU02780   0,0 -0,7 0,0 0,1 0,8 1,1 -0,7 -0,6 -2,8 -1,9 -2,0 -2,1
A ycnK BSU03960   0,0 -2,8 2,0 -0,8 -1,3 -1,7 -1,8 -1,7 -2,4 0,8 0,4 0,5
A yddJ BSU04990   0,0 1,6 1,8 1,0 0,8 0,3 0,3 0,7 0,7 -1,9 -1,6 -1,4
A yddT BSU05100   0,0 0,3 0,1 -0,8 -0,9 -1,0 -1,0 -0,7 -0,4 0,3 0,4 0,6
A ydeH BSU05200   0,0 1,6 1,6 2,3 2,5 2,0 1,2 1,4 0,9 0,4 0,3 0,5
A ydeJ BSU05220   0,0 -0,1 0,6 -0,6 -1,1 -1,4 -1,1 -1,2 -1,1 -0,9 -0,5 -0,9
A ydjG BSU06190   0,0 -1,0 -2,6 -4,4 -4,8 -5,3 -4,9 -6,0 -5,6 -1,8 -1,5 -2,2
A ydjH BSU06200   0,0 -0,4 -2,3 -4,1 -4,5 -5,1 -5,0 -5,7 -5,6 -1,1 -0,8 -1,6
A ydjI BSU06210   0,0 -0,6 -2,2 -3,9 -4,2 -4,7 -4,3 -4,9 -4,3 -1,2 -1,0 -1,7
A yerI BSU06640   0,0 -0,6 0,4 -0,2 -0,3 -0,5 -0,7 -0,9 -1,4 -1,5 -1,5 -1,7
A yflA BSU07750   0,0 -1,8 -1,1 -1,9 -2,1 -2,2 -1,8 -2,3 -2,1 -2,1 -1,7 -1,9
A yflB BSU07735   0,0 0,2 0,4 0,0 0,7 1,0 2,0 1,9 1,7 -0,3 -0,3 -0,1
A yfmG BSU07480   0,0 3,5 4,1 2,7 2,4 0,5 -1,5 -1,2 -1,3 -2,0 -2,1 -2,2
A yfmH BSU07470   0,0 2,2 2,4 0,5 -0,6 -1,4 -2,2 -1,6 -1,3 -0,4 -0,4 -0,4
A yfmI BSU07460   0,0 2,2 2,4 0,5 -0,6 -1,4 -2,2 -1,6 -1,3 -0,4 -0,4 -0,4
A yfmJ BSU07450   0,0 1,1 1,8 0,5 -0,1 -0,6 -0,9 -1,0 -1,6 -0,2 -0,1 -0,4
A yhaP BSU09900   0,0 -1,5 -1,4 -1,3 -1,6 -1,6 -2,8 -3,2 -3,6 -0,4 -0,7 -0,7
A yhaQ BSU09890   0,0 -1,2 -1,1 -1,2 -1,2 -1,4 -2,5 -2,6 -3,2 -0,6 -0,4 -0,6
A yheJ BSU09700   0,0 1,3 1,4 0,8 1,2 1,0 0,9 1,2 0,9 -2,1 -1,3 -0,9
A yjcM BSU11910   0,0 1,0 -0,2 -2,1 -2,3 -3,3 -4,9 -3,8 -3,6 -2,6 -1,3 -2,5
A yjdB BSU11990   0,0 -0,7 3,0 1,9 0,5 -0,1 -0,3 0,0 -0,2 -3,8 -3,3 -3,9
A yjdG BSU12040   0,0 1,1 0,9 2,6 3,5 3,7 3,1 3,0 2,8 -0,4 -0,4 -0,4
A yknW BSU14340   0,0 -1,1 -1,2 -1,0 -0,8 -0,8 -0,4 -1,1 -0,6 -2,0 -1,5 -2,6
A yknX BSU14350   0,0 -1,1 -1,5 -1,4 -1,1 -1,5 -2,3 -2,5 -2,9 -1,7 -1,4 -2,2
A yknY BSU14360   0,0 -1,0 -1,4 -1,2 -1,0 -1,4 -1,7 -2,1 -2,6 -1,6 -1,4 -2,2
A yknZ BSU14370   0,0 -1,2 -1,5 -1,3 -1,2 -1,4 -1,4 -2,0 -2,3 -1,3 -1,4 -2,1
A ykuU BSU14220   0,0 0,5 1,0 1,7 2,0 1,5 1,0 1,3 0,7 -1,0 -1,0 -0,9
A ykuV BSU14230   0,0 0,5 1,0 1,5 1,7 1,2 1,1 1,3 0,9 -0,7 -0,9 -0,7
A ylaE BSU14750   0,0 -0,2 -0,2 -1,0 -1,5 -1,7 -2,1 -1,8 -1,8 -0,7 -0,6 -0,6
A ylbA BSU14940   0,0 0,7 1,8 1,9 1,8 1,3 1,2 1,3 1,2 -2,6 -2,1 -2,0
A ylqB BSU15960   0,0 -0,5 -0,4 -2,3 -1,9 -3,0 -3,0 -3,1 -3,3 -6,4 -6,1 -5,9
A ymaE BSU17250   0,0 0,9 1,6 0,3 -0,5 -1,1 -1,6 -1,8 -1,9 -2,1 -1,7 -2,0
A ymzB BSU17240   0,0 0,7 1,3 1,5 2,5 2,9 3,2 3,2 2,9 -2,3 -2,3 -2,7
A yncM BSU17690   0,0 0,1 1,2 -0,2 -0,4 -1,0 -1,1 -1,0 -1,2 -3,1 -2,7 -2,8
A ynzD BSU17920   0,0 0,9 1,6 0,6 0,5 -0,2 -0,5 0,5 0,1 -0,6 -0,8 -0,2
A yoaW BSU18780   0,0 1,2 3,0 3,8 3,9 3,7 3,3 3,4 3,2 0,2 0,0 -0,1
A yobB BSU18820   0,0 0,6 3,5 2,3 2,3 2,1 1,3 1,3 0,8 -1,6 -1,6 -1,7
A yobO BSU19030   0,0 1,1 2,7 1,8 1,9 1,6 1,6 1,4 1,3 -2,6 -2,5 -2,6
A yocD BSU19170   0,0 1,2 1,2 0,4 0,0 -0,1 -0,4 -0,1 -0,2 0,6 0,7 0,9
A yocH BSU19210   0,0 1,2 2,7 2,5 2,9 2,9 0,9 2,5 0,4 0,2 -0,7 -0,2
A yokI BSU21580   0,0 0,5 0,9 -0,1 -0,3 -1,1 -1,9 -1,8 -2,5 -0,4 -0,2 -0,2
A yokJ BSU21570   0,0 0,6 0,8 -0,2 -0,6 -1,3 -2,8 -1,6 -2,2 -0,7 -0,6 -0,5
A yokK BSU21560   0,0 0,2 0,5 -0,3 -0,8 -1,6 -2,9 -1,7 -2,3 -0,9 -0,7 -0,7
A yokL BSU21550   0,0 0,1 0,3 -0,6 -1,0 -1,8 -2,7 -1,2 -1,2 -0,7 -0,8 -0,9
A yolA BSU21540   0,0 -0,9 -1,5 -3,6 -3,6 -4,6 -4,2 -4,5 -3,9 -6,5 -5,4 -6,3
A yolB BSU21530   0,0 -0,9 -1,4 -3,5 -3,5 -4,4 -3,8 -4,1 -3,4 -6,5 -5,5 -6,4
A yolC BSU21520   0,0 0,8 2,2 0,8 0,8 0,4 0,4 0,3 0,4 -2,7 -2,5 -2,9
A yomJ BSU21340   0,0 0,1 0,1 -0,4 -0,3 -0,6 -0,7 -0,4 -0,8 -1,8 -1,9 -2,0
A yoqM BSU20580   0,0 -1,9 2,3 0,3 -0,6 -0,7 -0,5 -0,2 0,1 -3,9 -4,2 -4,2
A yorD BSU20420   0,0 0,3 -0,4 -1,9 -1,9 -3,1 -3,7 -2,8 -2,9 -3,6 -2,9 -2,8
A yphE BSU22820   0,0 1,2 1,4 1,0 0,8 0,4 -1,1 0,2 -2,0 0,4 0,4 0,2
A yphF BSU22810   0,0 1,7 1,6 1,4 1,1 1,1 -0,4 0,5 -1,0 0,3 0,2 0,3
A yqaP BSU26230   0,0 0,2 0,0 -1,3 -1,8 -3,0 -3,4 -2,8 -3,1 -1,7 -1,2 -1,7
A yqcF BSU25870   0,0 -0,6 0,6 -0,5 -0,8 -1,5 -2,2 -1,3 -1,9 -0,9 -1,1 -1,3
A yqcG BSU25860   0,0 0,2 1,6 0,4 0,2 -0,3 -1,5 -0,7 -1,7 -0,4 -0,1 -0,5
A yqxI BSU25890   0,0 -0,9 1,2 -0,3 -0,9 -2,1 -3,1 -3,0 -4,2 -3,1 -3,0 -2,7
A yqxJ BSU25880   0,0 -0,5 1,5 -0,1 -0,6 -1,8 -2,8 -2,4 -3,3 -2,7 -2,8 -2,4
A yqzG BSU24650   0,0 -0,2 0,4 5,5 6,2 6,0 5,7 5,7 5,8 -0,2 -0,5 -0,2
A yrpD BSU26820   0,0 -1,3 0,0 -1,1 -1,6 -2,3 -3,7 -2,9 -4,8 -4,9 -3,6 -4,9
A yrzI BSU27190   0,0 -0,6 -0,3 0,0 0,0 0,9 2,2 3,2 2,9 -2,8 -1,9 -2,9
A yscB BSU28890   0,0 -0,7 -0,9 -3,0 -3,0 -3,4 -2,0 -3,0 -1,4 -4,1 -3,8 -3,8
A yuaB BSU31080   0,0 -2,8 -0,9 -1,6 -1,9 -2,8 -4,5 -4,9 -6,1 -3,9 -3,0 -3,7
A yurI BSU32540   0,0 0,9 2,0 1,7 1,5 1,5 1,8 0,3 -0,3 -1,2 -0,6 -0,8
A yvcA BSU34850   0,0 0,5 1,8 0,7 0,3 0,1 -1,4 -0,9 -1,3 0,3 0,6 0,5
A yvcB BSU34840   0,0 -0,8 0,6 -0,4 -0,6 -1,0 -2,1 -1,7 -2,6 -0,7 -0,6 -0,7
A yvgO BSU33410   0,0 -1,4 0,0 -0,7 -0,8 -0,8 0,0 -1,2 -1,0 -1,9 -1,7 -1,7
A yvmC BSU35070   0,0 -2,7 -1,9 -3,1 -3,6 -4,0 -4,1 -4,0 -3,8 -2,4 -2,1 -2,3
A yvnA BSU35050   0,0 0,9 1,7 1,3 1,8 1,7 1,3 1,6 1,4 -1,5 -1,0 -1,2
A yvqJ BSU33140   0,0 1,0 2,1 1,3 1,1 1,1 0,3 -0,6 -1,8 -2,4 -1,9 -2,1
A yvrN BSU33260   0,0 -0,5 -0,7 -1,9 -2,2 -2,9 -3,6 -4,3 -5,0 -2,0 -1,9 -2,3
A yvrO BSU33270   0,0 0,0 -0,1 -1,3 -1,8 -2,3 -3,4 -3,9 -4,4 -1,9 -1,6 -2,2
A yvrP BSU33280   0,0 0,2 -0,1 -1,2 -1,7 -2,1 -3,7 -3,8 -4,4 -2,1 -1,4 -2,0
A yvzA BSU34830   0,0 -1,3 0,0 -0,9 -1,0 -1,5 -2,2 -2,1 -2,5 -1,2 -1,3 -1,3
A ywbF BSU38340   0,0 0,1 0,0 -0,4 -0,4 -0,2 -1,1 -1,7 -2,4 -0,8 -0,4 -0,7
A yweA BSU37800   0,0 0,5 -0,8 -1,8 -2,6 -3,2 -3,0 -2,9 -3,3 -4,4 -3,6 -4,4
A ywoF BSU36460   0,0 0,0 1,6 0,0 -0,3 -0,2 -0,5 -0,8 -1,1 -1,2 -1,0 -1,3
A yxaA BSU40040   0,0 0,1 0,3 -0,9 -1,2 -1,4 -1,7 -1,8 -1,8 -0,1 0,5 0,0
A yxaB BSU40030   0,0 -0,3 -0,2 -0,9 -1,1 -0,8 0,0 -0,7 -0,9 -0,4 -0,2 -0,4
A yxaJ BSU39950   0,0 -1,1 -1,4 -2,8 -3,4 -3,6 -3,9 -3,7 -3,8 -2,7 -1,6 -2,1
A yxaL BSU39940   0,0 -2,5 -0,3 -3,3 -4,1 -4,8 -4,7 -5,0 -5,3 -4,1 -3,3 -4,1
A yxaM BSU39930   0,0 6,0 5,7 5,1 4,7 3,6 2,0 2,3 1,2 0,7 0,6 0,6
A yxbA BSU39900   0,0 6,4 6,2 6,1 5,6 4,7 3,6 4,0 3,4 -1,5 -1,4 -1,5
A yxbB BSU39890   0,0 5,8 5,9 5,7 5,3 4,4 3,3 3,8 3,2 -2,1 -2,2 -2,2
A yxbC BSU39880   0,0 4,0 4,1 4,0 3,6 2,7 2,1 2,5 2,2 -2,8 -2,5 -2,9
A yxbD BSU39870   0,0 3,5 3,0 2,1 1,6 0,6 -0,8 -0,4 -0,9 -1,1 -0,6 -0,8
A yxeD BSU39590   0,0 0,1 0,0 1,7 5,0 7,2 6,9 6,8 7,1 -0,1 0,0 0,1
A yxnB BSU39910   0,0 6,4 6,2 6,0 5,6 4,7 3,6 3,8 3,2 -0,4 -0,4 -0,3
A yxzE BSU38790   0,0 -1,5 -2,1 -3,0 -2,8 -2,9 -1,3 -3,3 -1,4 -0,9 -1,1 -1,2
A yydF BSU40180   0,0 2,3 2,6 1,9 2,1 0,8 0,1 0,9 0,8 -4,3 -4,5 -4,4
A yydG BSU40170   0,0 2,9 2,3 0,3 0,1 -1,1 -3,3 -2,0 -1,1 -1,8 -1,8 -1,9
A yydH BSU40160   0,0 2,2 1,7 0,4 0,0 -1,1 -1,4 -1,6 -1,1 -1,3 -1,2 -1,2
A yydI BSU40150   0,0 1,8 1,2 0,2 -0,2 -1,1 -1,7 -1,5 -1,5 -1,4 -1,3 -1,4
A yydJ BSU40140   0,0 1,9 1,5 0,1 -0,4 -1,2 -1,8 -1,5 -1,3 -1,0 -0,9 -1,2
B amyE BSU03040   0,0 1,1 1,4 0,5 0,5 0,0 -0,1 0,0 -0,9 0,4 0,6 0,2
B glpD BSU09300   0,0 -3,2 -1,8 -2,0 -2,5 -1,9 -0,2 -1,7 -1,1 0,9 3,4 -0,1
B glpF BSU09280   0,0 -1,2 -1,0 -0,2 -0,1 -0,2 0,7 0,1 0,8 -0,3 2,0 -1,1
B gmuA BSU05820   0,0 -3,2 -3,9 -3,9 -4,1 -3,9 -3,3 -4,2 -4,1 -1,7 -0,3 -1,7
B gmuB BSU05810   0,0 -3,4 -4,2 -4,2 -4,5 -4,1 -3,4 -4,4 -4,0 -2,2 -0,5 -1,9
B gmuC BSU05830   0,0 -2,4 -3,1 -2,9 -3,1 -2,9 -2,5 -3,6 -3,7 -0,9 0,4 -1,1
B gmuD BSU05840   0,0 -1,3 -1,9 -1,5 -1,7 -1,4 -0,6 -1,9 -1,9 0,2 1,5 0,0
B gmuE BSU05860   0,0 0,3 0,0 0,2 -0,2 0,1 0,5 -0,9 -1,1 0,8 2,1 0,6
B gmuF BSU05870   0,0 0,3 0,0 0,2 -0,1 0,2 0,6 -0,6 -0,5 0,8 2,2 0,6
B gmuG BSU05880   0,0 0,4 0,3 0,7 0,7 0,7 1,3 0,7 0,8 0,8 2,2 0,7
B gmuR BSU05850   0,0 0,0 -0,3 -0,1 -0,4 -0,1 0,3 -0,7 -0,7 0,9 1,8 0,8
B rbsA BSU35940   0,0 -0,3 -2,5 -2,4 -1,4 -1,4 -1,7 -1,5 -2,0 -3,4 0,2 -4,2
B rbsB BSU35960   0,0 -0,5 -2,3 -2,4 -1,3 -1,5 -1,8 -1,6 -2,3 -3,3 0,4 -4,2
B rbsC BSU35950   0,0 -0,6 -2,6 -2,7 -1,6 -1,8 -1,9 -1,8 -2,4 -3,3 0,4 -4,3
B rbsD BSU35930   0,0 -0,3 -2,4 -2,2 -1,3 -1,3 -1,6 -1,3 -1,8 -3,0 0,2 -3,7
B rbsK BSU35920   0,0 -0,4 -2,1 -2,2 -1,5 -1,4 -1,4 -1,5 -1,9 -2,4 0,2 -3,1
B rbsR BSU35910   0,0 -0,2 -1,8 -2,3 -1,5 -1,6 -2,4 -1,8 -3,3 -2,2 0,5 -2,5
B scoC BSU09990   0,0 2,1 1,2 1,3 1,0 0,9 0,4 0,5 0,4 -1,6 -1,7 -1,8
C appB BSU11390   0,0 5,5 4,3 3,5 2,8 2,4 2,9 2,3 2,3 -1,8 -1,4 -1,6
C appC BSU11400   0,0 5,6 4,4 3,6 2,8 2,5 2,9 2,5 2,5 -1,5 -1,3 -1,4
C appD BSU11360   0,0 2,6 1,8 1,7 1,2 1,3 1,0 1,1 1,2 -4,4 -4,5 -4,4
C appF BSU11370   0,0 3,5 2,8 2,7 2,2 2,1 1,8 1,8 1,9 -3,9 -3,8 -4,0
C flgM BSU35430   0,0 0,0 0,5 -0,8 -0,5 -0,9 -1,3 -1,6 -1,7 -2,8 -2,8 -2,6
C hag BSU35360   0,0 0,2 0,1 -1,6 -1,1 -2,0 -2,2 -2,0 -2,0 -6,2 -4,8 -5,7
C oppA BSU11430   0,0 1,6 0,8 -0,5 -0,7 -1,0 -1,1 -0,7 -1,1 -4,1 -3,5 -4,0
C oppB BSU11440   0,0 1,6 0,4 -1,7 -2,4 -2,7 -3,0 -2,9 -3,4 -2,9 -2,1 -2,7
C oppC BSU11450   0,0 1,8 0,6 -1,5 -2,2 -2,6 -2,6 -2,4 -2,9 -2,7 -2,0 -2,5
C oppD BSU11460   0,0 1,9 0,7 -1,3 -1,9 -2,2 -2,3 -1,8 -2,7 -2,7 -2,2 -2,6
C oppF BSU11470   0,0 1,9 0,7 -1,4 -1,9 -2,1 -2,0 -1,9 -2,5 -2,6 -2,1 -2,4
C phoP BSU29110   0,0 0,9 0,2 1,4 1,5 1,5 0,8 0,6 0,7 -1,0 -0,7 -0,9
C phoR BSU29100   0,0 0,7 -0,2 1,2 1,2 1,2 0,8 0,6 0,6 -0,6 -0,6 -0,7
C yclF BSU03670   0,0 -0,7 -0,1 2,9 2,2 1,8 2,1 1,8 1,9 3,4 3,0 3,0
D lutA BSU34050   0,0 0,6 0,2 0,3 -0,1 -0,1 -1,2 -0,7 -1,4 -1,8 -1,0 -1,5
D lutB BSU34040   0,0 0,1 -0,1 0,0 -0,5 -0,4 -1,2 -0,9 -1,5 -1,9 -1,2 -1,6
D lutC BSU34030   0,0 0,1 -0,4 -0,2 -0,6 -0,6 -0,9 -0,7 -1,1 -1,6 -1,4 -1,7
D spoIIE BSU00640   0,0 -0,4 5,7 5,3 4,5 4,1 3,1 3,9 3,5 3,2 2,7 3,1
D yvgN BSU33400   0,0 -0,3 -0,1 -1,3 -0,7 -1,0 -1,1 -0,7 -0,7 0,6 0,5 0,6
D ywbD BSU38360   0,0 0,0 -0,2 -0,7 -0,9 -0,7 -0,2 -0,7 -0,6 1,3 1,0 1,2
E abn2 BSU39330   0,0 1,1 2,3 0,6 0,7 0,5 0,9 0,5 0,1 -3,1 -2,8 -3,0
E alkA BSU01800   0,0 0,2 -0,1 2,4 2,8 2,8 2,5 2,4 2,6 0,5 0,4 0,6
E aprX BSU17260   0,0 0,7 0,3 1,3 0,1 0,0 0,9 1,6 4,1 0,3 0,0 0,4
E arsB BSU25790   0,0 -0,7 -1,1 1,8 1,6 1,1 1,5 1,1 1,2 0,2 0,1 0,3
E arsC BSU25780   0,0 -0,9 -1,1 1,9 2,0 1,5 1,8 1,4 1,7 0,0 -0,2 0,1
E arsR BSU25810   0,0 0,2 -0,2 0,0 0,0 0,4 0,4 0,8 1,3 0,4 0,5 1,1
E azoR2 BSU33540   0,0 0,4 1,8 2,7 3,7 4,0 3,3 3,9 3,3 1,3 1,2 1,6
E ccdA BSU17930   0,0 1,0 2,1 2,3 1,9 1,6 0,9 0,7 -0,3 1,2 0,9 1,1
E citG BSU33040   0,0 0,3 0,6 -0,5 -0,8 -1,3 -2,4 -1,4 -2,8 -1,1 -1,0 -1,0
E disA BSU00880   0,0 1,5 1,2 0,3 -0,1 -0,2 0,4 -0,1 0,8 0,9 1,0 0,9
E dnaA BSU00010   0,0 1,2 0,2 -1,1 -1,6 -2,2 -3,0 -2,8 -3,6 1,6 1,6 1,7
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E dnaN BSU00020   0,0 0,8 -0,5 -1,7 -2,2 -2,7 -3,1 -3,3 -3,6 1,5 1,5 1,5
E dra BSU39420   0,0 -0,7 -0,9 -2,4 -2,6 -2,3 -2,6 -2,9 -3,0 0,3 0,4 0,3
E exuR BSU12370   0,0 -0,2 -0,1 2,1 1,4 1,4 1,3 1,0 1,0 -0,2 -0,2 -0,2
E exuT BSU12360   0,0 0,2 0,4 4,6 4,0 3,5 3,5 2,4 1,8 -0,2 0,3 -0,1
E fabL BSU08650   0,0 -0,5 -0,9 -1,2 -1,6 -2,2 -2,7 -2,6 -2,7 1,0 1,2 1,2
E ftsY BSU15950   0,0 -1,9 -1,5 -1,9 -2,2 -2,8 -2,5 -2,9 -3,0 0,7 0,3 0,6
E hbs BSU22790   0,0 0,3 0,2 0,2 0,1 -0,8 -1,5 -0,9 -1,4 0,2 0,2 0,4
E hmp BSU13040   0,0 -2,5 -1,4 -2,2 -1,6 1,1 1,3 0,7 1,4 -1,3 -0,9 -1,0
E jag BSU41030   0,0 0,0 -0,6 -1,2 -1,9 -2,4 -2,6 -2,3 -2,8 1,9 1,3 1,5
E kinB BSU31450   0,0 2,1 2,0 0,8 0,1 -0,4 -1,3 -1,2 -0,8 -1,0 -0,6 -0,7
E kinC BSU14490   0,0 -0,6 -1,1 -2,7 -3,0 -3,5 -3,6 -3,2 -3,0 -0,6 -0,4 -0,5
E kinE BSU13530   0,0 1,3 2,3 0,8 0,3 -0,1 -0,8 -0,3 -0,8 -2,5 -2,4 -2,4
E lytE BSU09420   0,0 1,7 1,3 0,4 -0,1 -0,5 -2,1 -0,3 -1,4 2,4 2,2 2,4
E mutTA BSU30630   0,0 -0,7 -1,4 -1,2 -1,3 -1,0 -1,3 -0,9 -0,2 -0,4 -0,4 -0,2
E mutY BSU08630   0,0 -0,4 -0,8 -1,5 -1,8 -2,1 -0,9 -1,5 -1,1 1,6 1,6 1,5
E nupC BSU39410   0,0 -1,0 -1,4 -2,7 -2,7 -2,5 -2,3 -2,6 -2,9 0,5 0,3 0,1
E opuD BSU30070   0,0 0,0 -0,1 -0,6 -0,7 -0,7 -0,7 -1,2 -1,9 0,7 0,4 0,3
E pbpF BSU10110   0,0 -0,9 -0,8 0,0 1,1 1,0 1,7 1,4 1,5 1,4 1,2 1,4
E pdp BSU39400   0,0 -1,2 -1,5 -2,7 -2,8 -2,5 -2,1 -2,5 -2,8 0,1 -0,1 -0,3
E phoA BSU09410   0,0 1,3 1,0 1,8 3,6 4,3 4,3 4,1 4,4 0,4 0,8 0,6
E phoB BSU05740   0,0 0,0 0,7 5,3 5,2 5,1 5,2 4,7 4,9 1,0 1,1 1,3
E phrA BSU12440   0,0 1,2 1,5 1,5 1,5 1,4 1,2 1,5 1,1 -4,5 -4,4 -4,7
E phrI BSU05020   0,0 0,7 0,6 1,1 2,0 1,7 1,7 2,1 2,1 -1,8 -1,9 -1,6
E ppiB BSU23360   0,0 -0,7 -0,7 -1,1 -1,3 -1,9 -2,2 -1,7 -1,7 0,2 0,0 0,5
E proH BSU18480   0,0 0,8 1,6 3,8 4,3 4,2 3,5 2,8 3,1 0,5 0,6 0,8
E proJ BSU18470   0,0 0,6 1,3 3,8 4,0 3,9 3,4 2,7 3,0 1,2 1,1 1,2
E pucH BSU32410   0,0 0,1 -0,1 2,5 2,8 2,8 2,8 2,0 1,2 0,6 0,5 0,7
E putB BSU03200   0,0 3,6 -3,2 -1,7 -0,5 0,4 0,1 -1,1 -0,2 -4,1 -4,1 -4,2
E putC BSU03210   0,0 4,1 -2,6 -0,7 0,4 1,0 1,2 0,3 1,2 -3,9 -3,8 -3,9
E rapA BSU12430   0,0 1,1 1,2 1,1 1,1 1,2 0,9 1,1 0,7 -4,9 -4,7 -5,2
E rapB BSU36690   0,0 1,0 0,7 0,3 -0,1 -0,2 -0,6 -0,4 -1,0 -0,6 -0,7 -0,8
E rapE BSU25830   0,0 0,6 1,4 1,4 0,6 0,6 -0,5 0,9 0,1 -2,1 -1,9 -2,2
E ribH BSU23250   0,0 2,5 0,0 0,3 0,2 0,5 1,8 2,0 2,1 0,9 1,7 0,6
E rnc BSU15930   0,0 -1,3 -0,9 -1,4 -1,7 -2,1 -2,7 -2,7 -3,2 0,2 -0,2 -0,1
E sbp BSU15270   0,0 -0,8 -1,4 -2,1 -2,7 -2,9 -3,5 -3,3 -3,7 0,8 0,4 0,4
E smc BSU15940   0,0 -1,4 -1,1 -1,6 -2,1 -2,4 -2,9 -2,7 -2,8 1,3 1,1 1,4
E spo0B BSU27930   0,0 -0,6 -0,6 -0,9 -1,0 -0,5 -0,8 -0,8 -0,6 1,2 0,9 1,2
E spo0F BSU37130   0,0 0,6 2,1 0,1 -0,2 -0,8 -1,1 -0,9 -1,7 -1,0 -1,1 -0,9
E spoIIIE BSU16800   0,0 -0,1 -0,2 -0,7 -0,7 -0,2 -0,3 -0,4 -0,3 0,7 0,6 0,6
E spoIIIJ BSU41040   0,0 0,3 -0,2 -1,0 -1,5 -2,2 -2,7 -2,2 -3,2 1,8 1,5 1,4
E spoIISA BSU12830   0,0 0,1 0,6 1,6 1,9 1,8 2,0 1,7 1,7 0,8 0,4 0,9
E sspE BSU08660   0,0 -0,3 -0,9 1,3 2,3 2,3 2,3 2,3 2,4 0,8 0,6 0,6
E uxaB BSU12380   0,0 -0,3 -0,5 0,0 -0,3 -0,3 0,0 -0,5 -0,3 0,5 0,8 0,6
E uxuA BSU12340   0,0 0,3 0,8 5,6 5,0 4,8 4,6 4,1 3,8 -0,1 0,4 -0,1
E ydhF BSU05730   0,0 0,0 0,3 4,3 4,2 4,0 4,4 3,8 4,3 0,9 0,8 1,1
E yhcY BSU09320   0,0 0,2 0,5 -0,2 -0,6 -0,4 -0,7 -1,3 -1,3 0,0 0,2 0,0
E yhcZ BSU09330   0,0 0,4 0,7 0,2 -0,4 0,0 -0,1 0,1 0,1 -0,4 -0,3 -0,3
E yhjL BSU10550   0,0 0,6 0,7 -0,3 -0,6 -0,7 -0,5 0,1 0,3 0,3 0,3 0,4
E yjmC BSU12320   0,0 0,3 0,9 6,0 6,1 6,1 5,6 5,3 5,1 0,1 0,3 -0,1
E yjmD BSU12330   0,0 0,2 0,9 5,9 5,6 5,5 5,2 4,7 4,7 -0,2 0,4 -0,2
E yjmF BSU12350   0,0 0,2 0,6 5,3 4,7 4,3 4,1 3,4 2,7 -0,1 0,3 -0,1
E yqcK BSU25800   0,0 -0,6 -0,9 2,4 2,2 1,6 2,1 1,7 2,1 0,3 0,3 0,6
E yrhA BSU27260   0,0 1,8 -0,7 -0,3 -0,5 1,3 2,6 1,3 1,8 1,4 1,2 1,6
E ywoC BSU36490   0,0 -1,2 -1,3 0,2 2,0 2,5 2,7 2,2 2,9 0,2 0,5 0,4
F phrG BSU40310   0,0 1,3 2,1 1,6 1,9 1,9 1,3 1,4 1,3 -2,2 -1,7 -1,7
F rapG BSU40300   0,0 1,1 1,0 0,2 -0,4 -1,0 -0,8 -0,5 -0,5 -0,8 -0,3 -0,7
F sigE BSU15320   0,0 0,3 6,2 6,7 6,2 5,8 4,6 5,1 4,5 0,2 0,4 0,3
F sinR BSU24610   0,0 0,1 0,8 1,3 1,7 1,7 1,1 1,3 1,0 -0,6 -1,0 0,0
F spo0A BSU24220   0,0 1,2 2,5 1,6 1,3 1,2 0,8 0,7 0,7 0,1 -0,1 0,2
F spoIIGA BSU15310   0,0 0,4 5,8 6,0 5,5 4,9 4,2 4,7 4,0 0,2 0,4 0,1
G epr BSU38400   0,0 0,8 -0,2 -2,5 -3,0 -3,5 -3,1 -4,0 -3,5 -5,1 -4,3 -4,9
H nprE BSU14700   0,0 1,8 0,5 -0,5 -1,3 -1,6 -1,6 -2,4 -2,2 -1,8 -0,7 -1,5
I rok BSU14240   0,0 1,1 1,2 -0,2 -0,8 -1,1 -1,9 -1,1 -0,9 0,8 0,6 1,0
I sigF BSU23450   0,0 1,4 5,7 5,7 5,5 4,9 4,5 5,1 4,8 -2,0 -1,9 -1,7
I sigG BSU15330   0,0 0,2 4,6 5,9 6,5 6,3 5,9 5,9 6,0 0,8 0,3 1,1
I slrR BSU34380   0,0 -0,2 0,5 1,9 1,7 1,3 0,6 0,1 0,3 -0,5 -0,7 -0,9
I spoIIAA BSU23470   0,0 1,5 5,7 5,7 5,7 4,9 4,4 4,8 4,4 -2,3 -2,0 -2,2
I spoIIAB BSU23460   0,0 1,3 5,8 5,5 5,5 4,7 4,2 4,7 4,4 -2,4 -1,9 -2,2
I spoVG BSU00490   0,0 1,1 1,1 1,0 1,0 0,7 0,1 0,8 0,4 -4,4 -3,9 -4,1
J epsA BSU34370   0,0 0,1 1,7 2,7 2,3 0,8 -1,9 -2,2 -2,1 -1,9 -1,0 -1,9
J epsB BSU34360   0,0 0,0 1,8 2,7 2,1 1,0 -0,7 -1,6 -1,6 -1,8 -1,2 -1,8
J epsC BSU34350   0,0 0,0 1,6 1,9 0,8 -0,4 -2,0 -2,2 -2,2 -1,4 -0,6 -1,0
J epsD BSU34340   0,0 -0,5 1,1 1,5 0,5 -1,2 -2,8 -2,9 -3,0 -2,0 -1,3 -1,6
J epsE BSU34330   0,0 -0,8 0,8 1,2 0,3 -1,5 -2,9 -3,0 -3,1 -2,2 -1,4 -1,8
J epsF BSU34320   0,0 -1,0 0,4 0,8 -0,3 -1,8 -2,6 -2,7 -2,8 -2,0 -1,5 -1,7
J epsG BSU34310   0,0 -1,1 0,1 0,5 -0,5 -2,1 -2,8 -3,0 -3,0 -2,1 -1,4 -1,8
J epsH BSU34300   0,0 -1,3 0,0 0,5 -0,6 -2,2 -2,9 -3,1 -3,1 -2,4 -1,6 -2,0
J epsI BSU34290   0,0 -1,4 0,0 0,3 -0,7 -2,3 -3,2 -3,5 -3,4 -2,7 -2,0 -2,4
J epsJ BSU34280   0,0 -1,4 -0,2 0,2 -0,9 -2,4 -3,1 -3,4 -3,5 -2,7 -2,0 -2,3
J epsK BSU34265   0,0 -1,4 -0,2 0,0 -1,2 -2,5 -3,1 -3,3 -3,4 -2,6 -1,9 -2,3
J epsL BSU34250   0,0 -1,4 0,1 0,2 -1,0 -2,5 -3,1 -3,3 -3,3 -2,7 -2,0 -2,5
J epsM BSU34240   0,0 -1,3 0,2 0,5 -0,6 -2,2 -3,0 -2,9 -2,9 -2,9 -2,4 -2,5
J epsN BSU34230   0,0 -1,2 0,3 0,5 -0,5 -2,3 -3,1 -3,4 -3,3 -3,0 -2,4 -2,7
J epsO BSU34220   0,0 -1,1 0,3 0,6 -0,3 -2,3 -3,2 -3,4 -3,3 -3,1 -2,6 -2,8
J sipW BSU24630   0,0 -0,4 2,0 1,8 1,6 0,1 -2,2 -2,0 -1,4 -2,3 -2,1 -2,4
J tapA BSU24640   0,0 -0,6 1,4 1,3 1,4 -0,3 -1,8 -1,5 -0,9 -1,9 -2,1 -2,4
J tasA BSU24620   0,0 -0,9 1,5 1,9 1,8 0,3 -2,2 -3,4 -3,4 -4,4 -3,8 -4,5
K bacA BSU37740   0,0 4,4 3,5 2,5 1,2 0,6 -1,0 -0,9 -0,5 -1,7 -1,7 -1,8
K bacB BSU37730   0,0 3,3 2,8 2,0 0,7 0,0 -1,0 -1,6 -2,0 -2,2 -1,4 -1,8
K bacC BSU37720   0,0 3,7 3,0 2,3 1,0 0,3 -0,8 -1,2 -1,7 -1,9 -0,9 -1,3
K bacD BSU37710   0,0 3,2 2,5 1,6 0,4 -0,4 -1,2 -1,8 -2,2 -1,5 -0,9 -1,3
K bacE BSU37700   0,0 2,7 1,9 0,9 -0,4 -1,1 -2,0 -2,4 -2,6 -1,2 -0,7 -1,0
K bacF BSU37690   0,0 2,4 1,7 0,6 -0,6 -1,1 -1,5 -2,1 -2,3 -1,2 -0,9 -0,9
L abrB BSU00370   0,0 -0,3 -2,2 -3,1 -3,4 -3,7 -4,0 -4,2 -4,5 -0,9 -2,0 0,0
L rapH BSU06830   0,0 0,4 1,1 0,0 -0,3 -1,0 -1,6 -1,7 -3,0 -4,0 -3,6 -3,8
L sigH BSU00980   0,0 0,9 1,0 -0,1 -0,3 -0,8 -2,1 -1,3 -2,2 -0,7 -0,5 -0,6
L spo0E BSU13640   0,0 0,6 0,8 -0,3 -0,3 -0,8 -0,7 -0,3 -0,6 -1,3 -1,3 -1,1
L ugd BSU36230   0,0 -0,8 -0,7 2,3 2,6 2,3 1,6 1,3 0,7 1,0 1,0 1,1
L ywcE BSU38130   0,0 1,9 -0,6 2,4 3,2 2,6 3,0 2,5 3,0 -2,3 -1,9 -2,0
M glpK BSU09290   0,0 -1,7 -1,4 -0,7 -0,4 -0,5 0,3 -0,1 0,5 -0,5 1,6 -1,4
M gntK BSU40060   0,0 -0,8 -1,8 -1,8 -2,1 -2,4 -2,5 -2,7 -3,1 1,0 1,9 0,5
M gntP BSU40070   0,0 -1,3 -2,3 -3,1 -3,5 -3,8 -4,0 -4,1 -4,4 0,6 1,5 -0,1
M gntR BSU40050   0,0 0,7 -0,2 -0,6 -0,8 -0,9 -1,2 -1,0 -1,3 2,3 3,1 1,9
M gntZ BSU40080   0,0 -2,0 -2,6 -2,3 -2,4 -3,1 -3,3 -3,2 -4,2 1,3 1,6 1,2
N aprE BSU10300   0,0 4,7 4,4 3,6 3,2 2,7 3,5 3,2 4,1 0,4 -0,4 -0,2
N sinI BSU24600   0,0 -0,4 2,0 2,9 3,2 2,9 2,3 2,7 2,4 -1,1 -0,9 -1,2

 

 

 

Class    
A = AbrB-
B = AbrB+
C = ScoC-
D = SinR-
E = SigA+
F = SinR-, SigA+
G = SinR-, ScoC-
H = ScoC-, AbrB-
I = SinR-, AbrB-
J = SinR-, AbrB-, SigA+
K = ScoC-, AbrB-, SigA+
L = SigA+, AbrB-
M = SigA+, AbrB+
N = ScoC-, SinR-, AbrB-, SigA+

Sporulation cycle of Bacillus subtilis

 Heatmap sorted on class,gene.

The - symbol indicates repression by the mentioned regulator, whereas the + symbol indicates activation..

 

 

Class
A= AbrB-
B= AbrB+
C= ScoC-
D= SinR-
E= SigA+
F= SinR-, SigA+
G= SinR-, ScoC-
H= ScoC-, AbrB-
I= SinR-, AbrB-
J= SinR-, AbrB-, SigA+
K= ScoC-, AbrB-, SigA+
L= SigA+, AbrB-
M= SigA+, AbrB+
N= ScoC-, SinR-, AbrB-, SigA+

 

 

Class

A

A

A

A

A

A

A

A

A

A

A

A

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A

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C

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C

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D

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